全能神教会与基督教的教会一样，都是因着神道成肉身的作工而产生的。基督教的教会是因着道成肉身的主耶稣的显现作工而产生的，全能神教会是因着末世道成肉身的全能神的显现作工而产生的，所以历世历代的教会都是因着神道成肉身的显现作工而产生的。神每一步道成肉身的作工都发表很多真理，都有许多人因着神所发表的真理而接受神、跟随神，这样，教会就因此产生了。由此可见，教会是由接受神作工、跟随神的人组成的，这些神选民的集合就称之为教会。两千年前，道成肉身的主耶稣显现作工，传“天国近了，你们应当悔改！”（马太福音4:17）的道，作了救赎工作，发表了恩典时代人该实行进入的真理，有许多人都信主跟随了主，就产生了当时的基督教教会。后来，主耶稣的福音传到各国各方，直到末世传遍地极，世界各国基督教的教会都因此而产生，这就是恩典时代的教会。末世，道成肉身的全能神显现作工在中国大陆，在恩典时代主耶稣救赎工作的基础上，作了圣经中预言的“审判要从神的家起首”（彼得前书4:17）的工作，向人类打开了神六千年经营计划的所有奥秘，发表了洁净、拯救人类的一切真理。因着末世全能神的显现作工，宗教界各宗各派有许多信主多年的人终于听见了神的声音，看见主耶稣已经回来了，作了末世审判的工作，他们都印证全能神就是主耶稣的再来，因此都接受了全能神的末世作工，归回到全能神面前，全能神教会也随之产生、建立。所以说，全能神教会完全是因着全能神的显现作工而产生的，是全能神亲自设立的，并不是哪一个人设立的。在中国大陆至少有几百万人接受、跟随了全能神，全能神教会的每一个基督徒都认定全能神就是主耶稣的再来，就是末后的基督，是神的显现。全能神教会的基督徒祷告的是全能神的名，读的、听的、交通的都是全能神的话，持守的是全能神所发表的一切真理，这些真理就是神末世带来的永远的生命之道。末世神道成肉身作工，亲自设立、见证神所使用的人来配合神的作工，就像主耶稣作工时亲自选用、设立十二使徒一样，但这些被神使用的人只是配合神的作工，不能代替神作工，教会不是神使用的人设立的，神选民信的、跟随的也不是神所使用的人。就如恩典时代的教会不是彼得、保罗等使徒设立的，而是因着主耶稣的作工产生的，是主耶稣亲自设立的。同样，末世全能神教会也不是神所使用的人设立的，而是因着全能神的作工产生的，是全能神亲自设立、亲自牧养的。神所使用的人只是浇灌、供应、带领众教会，是尽人的本分，神的选民虽然有神使用的人带领、浇灌、供应，但神选民信的是全能神，跟随的也是全能神，这是任何人都无法否认的事实。全能神教会的多数人都是从基督教、天主教等各宗各派里信主多年的人中转过来的，他们都明白圣经，接受全能神的末世作工后就在各宗各派中见证主耶稣已经回来了，就是全能神，发表真理作了末世审判的工作。有许多人因着看见了全能神的话都是真理，正是神的声音，就都接受了全能神，这些人就是第一批被提到神宝座前的人。现在，全能神的话语已经公布在网上面向世界，各种见证神末世作工的影视作品也越来越多，各国各方越来越多的人都在寻求考察后接受了全能神的末世作工，这就应验了圣经中的预言“万民都要流归这山”（以赛亚书2:2），最终所有真心信神的人都要归向全能神，这是大势所趋，因为这是神早已计划好的，是神的命定，无人能改变得了！正如全能神说：“我民必听我音，凡是真心爱我的人必会回归我的宝座之前的！”《话・卷一　神的显现与作工・神向全宇的说话・第一篇》